Biostatistics Teaching Unit

Biostatistics Teaching Unit - News

ORGANISATIONAL INFORMATION FOR STUDENTS IN THE ACADEMIC YEAR 2022/2023

Faculty of Medicine

Responsible for the subject: Krystyna Laszki-Szcząchor, PhD

krystyna.laszki-szczachor@umw.edu.pl

Please send any requests to transfer a subject only to the person responsible for the subject

Summer semester 2022/2023

Monday

BIM (Fundamentals of information technology and biostatistics) classes are attended by groups:
13, 14 – at 8.00
9, 10 – at 9.30
29, 30 – at 11.00
19, 20 – at 12.30
37, 38 – at 13.45

Location: Computer laboratory, room 8 at ul. Mikulicza-Radeckiego 7

Class dates:

Groups: 13, 9, 29, 19, 37: first classes: 27.02

Groups: 14, 10, 30, 20, 38: first classes: 06.03

Tuesday:

BIM (Fundamentals of information technology and biostatistics) classes are attended by groups:
27, 28 – at 8.00
33, 34 – at 9.30
7, 8 – at 11.00
21, 22 – at 12.30

Location: Computer laboratory, room 8 at ul. Mikulicza-Radeckiego

Class dates:

Groups: 27, 33, 7, 21:  first classes: 28.02

Groups: 28, 34, 8, 22:  first classes: 07.03

Thursday

BIM (Fundamentals of information technology and biostatistics) classes are attended by groups:

17, 18 – at 8.00
1, 2 – at 9.30
5, 6 – at 11.00
31, 32 – at 12.30

Location: Computer laboratory, room 8 at ul. Mikulicza-Radeckiego

Class dates:

Groups: 17, 1, 5, 31: first classes: 02.03

Groups: 18, 2, 6, 32: first classes: 09.03

Friday:

BIM (Fundamentals of information technology and biostatistics) classes are attended by groups:

11, 12 – at 8.00, room 8 at ul. Mikulicza-Radeckiego 7
25, 26 – at 9.30, room 8 at ul. Mikulicza-Radeckiego 7
3, 4 – at 11.00, computer laboratory at DS (student dormitory) Jubilatka, ul. Wojciecha z Brudzewa 10
35, 36 – at 12.30, computer laboratory at DS (student dormitory) Jubilatka, ul. Wojciecha z Brudzewa 10

15, 16 – at 12.30, room 8 at ul. Mikulicza-Radeckiego 7

23, 24 – at 14.00, room 8 at ul. Mikulicza-Radeckiego

Class dates:

Groups: 11, 25, 3, 35, 15, 23 : first classes: 03.03

Groups: 12, 26, 4, 36, 16, 24: first classes: 10.03

 

Doctoral School

Classes for the year I (Introduction to Biostatistics) begin with a lecture for the whole year on Monday 10.10 at 14:00 in the room at ul. Bartla.

Classes for the year II (Biomechanics) start:
on Thursday 13.10 for group 1 at 14:00
                                                   2 at 15:30
                                                   3 at 17:00

on Friday 14.10  for group    4 at 14:00
                                                  5 at 15:30

in the computer laboratory at DS (student dormitory) Jubilatka, ul. Wojciecha z Brudzewa 10 (ground floor).

Person responsible for classes:

Krzysztof Dudek, PhD
 e-mail: k.dudek@umw.edu.pl
tel. +48 601 864 148

Przedmiot: Podstawy technologii informacyjnej i biostatystyki

Krótki opis przedmiotu: najważniejsze informacje

Zajęcia z Podstaw technologii informacyjnej i biostatystyki podzielone są na dwie części tematyczne. W pierwszej części zapoznamy się z funkcjami pakietu Microsoft Office, w tym:

• z metodami edycji i redagowania tekstów naukowych (artykułów, raportów badawczych, prac dyplomowych) w programie MS Word.
• Podstawami analizy danych medycznych oraz ich wizualizacją. Ważnym aspektem będzie zebranie wszystkich danych i przedstawienie w postaci tabel, wykresów lub schematów z zastosowaniem przydatnych formuł i sortowania w pakiecie Microsoft Office i programie statystycznym Statistica.
• Prezentacją danych w formie prezentacji multimedialnej tworzonej w programie MS Power Point.

Druga część zajęć obejmie swoim zakresem elementy biostatystyki. Poznamy narzędzia pozwalające na znalezieniem prawidłowości w danych zebranych w gabinecie/przychodni/szpitalu lub w trakcie eksperymentu. Począwszy od najprostszego wyznaczenia statystyk opisowych, w tym wartości średniej i innych miar tendencji centralnej i rozrzutu. Poprzez przygotowanie prostych i bardziej złożonych układów doświadczalnych lub zastosowanie testów parametrycznych i nieparametrycznych do porównania, np. efektywności leków czy też skuteczności prowadzonej terapii. Kończąc na metodzie regresji prostej pozwalającej nam przewidywać wartość jednej zmiennej na podstawie znajomości wartości drugiej zmiennej.

Godziny konsultacyjne – na prośbę studentów, konsultacje online (przed konsultacjami podany będzie link do aplikacji Teams)

Opiekun roku I: dr Paweł Dąbrowski (Zakład Anatomii Prawidłowej)

PROGRAM WYKŁADÓW

Technologie informacyjne w medycynie

1. Wprowadzenie, historia, systemy komputerowe w opiece zdrowotnej i badaniach medycznych – 2,5 godz.
2. Roboty w medycynie - 2,5 godz.
3. Sztuczna inteligencja – 2,5 godz.
4. Telemedycyna i e-zdrowie – 2,5 godz.

Biostatystyka

5. Podstawowe pojęcia biostatystyczne, typy zmiennych losowych, zdarzenia losowe – 2,5 godz.
6. Układy doświadczalne stosowane w badaniach medycznych: badania prospektywne i retrospektywne – 2,5 godz.
7. Badania randomizowane i kliniczno-kontrolne oraz opisy przypadków i badania eksperymentalne – 2,5 godz.
8. Rozkład normalny i przedział ufności dla średniej – 2,5 godz.

Ćwiczenia kierunkowe –niekliniczne:

Technologie informacyjne w medycynie

1. Regulamin korzystania z laboratorium komputerowego, zapoznanie się z systemem operacyjnym, wyszukiwanie informacji w witrynach Uczelni, korzystanie z poczty elektronicznej, pliki graficzne – 2 godz.
2. Redagowanie tekstów medycznych w programie MS Word – formatowanie tekstu, praca z tabelami, odsyłacze – 2 godz.
3.  Arkusze Excela – tabele i wykresy, import danych, funkcje standardowe, tworzenie funkcji własnych – 2 godz.
4. Projekt łączący przygotowanie tabel i wykresów oraz krótkiego tekstu opisującego dany problem bazując na danych ilościowych i jakościowych - 2 godz.
5. Bazy danych – MS Excel/MS Word  - archiwizacja, wyszukiwanie, sortowanie, filtrowanie, komunikacja między programami MS Office – 2 godz.
6. Obsługa poradni i gabinetu lekarskiego, elektroniczna historia choroby – tworzenie tabel i raportów (tabele przestawne) – 2 godz.
7. Tworzenie prezentacji w MS Power Point – szablonów tekstów i tabel, prezentacji rycin, obsługa pełnej prezentacji, dźwięk i animacja – 2 godz.

8. Praktyczny test nr 1 przy komputerze rozszerzający umiejętności rozwiązywania nietypowych problemów z zakresu przygotowania danych i ich prezentacji – 1 godz.

Biostatystyka

1. Analiza wyników testu. Badanie rozkładów próbkowych przy pomocy histogramów. Miary położenia i miary rozrzutu jako podstawowe statystyki opisowe – 2 godz.
2. Graficzna prezentacja związków pomiędzy dwoma zmiennymi. Elementy epidemiologii: ryzyko względne, iloraz szans, czułość i swoistość testów diagnostycznych. – 2 godz.
3. Tabele wielodzielcze i test chi-kwadrat. – 2 godz.
4. Porównanie średnich dla prób zależnych i niezależnych – Test t-studenta. – 2 godz.
5. Jednoczynnikowa analiza wariancji. – 2 godz.
6. Zastosowanie regresji liniowej i współczynnika korelacji w badaniach medycznych. – 2 godz.
7. Test nr 2 przy komputerze rozszerzający umiejętności doboru znanych testów do sytuacji analizy rzeczywistych danych klinicznych (cechy mierzalne, dychotomiczne, powiązane, niepowiązane, opisujące różne właściwości obiektów). – 2 godz.

8. Analiza wyników praktycznego testu i poprawy kolokwiów – 1 godz.

Link do sylabusa danego przedmiotu: https://cloud.umw.edu.pl/index.php/s/WX9mXXGW2ebtdpT

Miejsce ćwiczeń: Sala 121

Terminy ćwiczeń (piątek)

I - 6.10.2023 r.

II – 13.10.2023 r.

III – 20.10.2023 r.

IV – 27.10.2023 r.

V – 3.11.2023 r.

VI – 10.11.2023 r.

VII – 17.11.2023 r.

VIII – 24.11. 2023 r.

IX – 1.12.2023 r.

X – 8.12.2023 r.

XI – 15.12.2023 r.

XII – 22.12. 2023 r.

XIII – 12.01. 2024 r.

XIV - 19.01.2024 r.

XV – 26.01.2024 r.

Fakultety do wyboru:

A. Bazy danych pacjentów – tworzenie i opracowywanie wyników (oddział szpitalny, przychodnia i gabinet)

• Prowadzący: dr hab. Krystyna Laszki-Szcząchor
• Liczba godzin: 10
• e-mail: krystyna.laszki-szczachor@umw.edu.pl,
• tel. 71 784 12 70

Plan fakultetu

• Tworzenie pustej bazy danych i tabel słownikowych (tezaurus) - (2 godz.),
• Projektowanie tabel dla lekarzy, pacjentów, recept i wizyt - (2 godz.),
• Opracowanie związków i relacji między obiektami - (2 godz.),
• Projektowanie opisów diagnostycznych i raportów (oddział, przychodnia, gabinet) - (2 godz.),
• Tworzenie autorskich opracowań i interpretacja wyników z utworzonych baz - (2 godz.).

B. Data science w medycynie: zaawansowana analiza danych

• Prowadzący: dr Agnieszka Rusiecka
• Liczba godzin: 10
• e-mail: agnieszka.rusiecka@umw.edu.pl
• tel. 71 784 12 66

Plan fakultetu

1. Data Science- wprowadzenie do zaawansowanej analizy danych - (2 godz.),
2. Zbieranie i gromadzenie danych. Typy danych w kontekście możliwej digitalizacji. Przepływy danych: rejestracja – transformacja – przechowanie - wykorzystanie. Omówienie zagadnień związanych z bezpieczeństwem danych - (2 godz.),
3. Klasyczna analiza danych a sztuczna inteligencja- zestawienie podstawowych pojęć związanych z podejściem do danych - (2 godz.),
4. Przetwarzanie języka naturalnego i text mining (2 godz.),
5. Data Science a wizualizacja danych, przedstawienie zaawansowanych możliwości graficznego przedstawiania danych (dashboard-y, PowerBI, Pakiet ggplot2 w pakiecie R) (2 godz.).