JPIAMR

Celem projektu jest opracowanie narzędzi opartych na dwóch nowatorskich metodach: droplet digital PCR (ddPCR) oraz biosensorach wolnych od PCR (PCR-free biosensors). Ten międzynarodowy projekt jest realizowany we współpracy trzech ośrodków: Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu (Polska – Koordynatorzy Projektu), University hospital Virgen del Rocío– Instituto de Biomedicina de Sevilla (Hiszpania) oraz University of Brest – University of Western Brittany (Francja). Do badań planujemy włączyć łącznie około 4300-4500 pacjentów niezakażonych wirusem HIV z grup ryzyka zarażenia Pneumocystis (chorzy na mukowiscydozę, pacjenci wymagający mechanicznej wentylacji, biorcy przeszczepów, pacjenci z chorobami hematologicznymi, noworodki i niemowlęta). Próbki z dróg oddechowych będą pobierane od pacjentów znajdujących się pod opieką szpitali współpracujących z wszystkimi trzema ośrodkami wchodzącymi w skład konsorcjum. W projekcie będą analizowane polimorfizmy pojedynczego nukleotydu (SNPs) w czterech genach Pneumocystis z wykorzystaniem dwóch nowych, czułych i powtarzalnych narzędzi (ddPCR, PCR-free biosensors). Wyniki zostaną porównane z analizami przeprowadzonymi za pomocą konwencjonalnych metod stosowanych dotychczas w diagnostyce Pneumocystis i jego charakterystyce molekularnej (Real-Time PCR, sekwencjonowanie DNA). W efekcie, zostaną zaproponowane nowe precyzyjne metody molekularne i/lub wysokoprzepustowe testy do szczegółowej analizy oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe u Pneumocystis. Ponadto, zostanie stworzona baza danych wykrytych mutacji przypuszczalnie związanych z opornością patogenu, w korelacji z danymi badanych pacjentów. Umożliwi to na określenie potencjalnych konsekwencji stosowania specyficznych terapii u pacjentów z grup ryzyka, a także możliwego wpływu tych mutacji na skuteczność profilaktyki/leczenia przeciw Pneumocystis u osoby zarażonej

Dofinansowanie: 1 950 254,00 zł
Całkowita wartość: 1 950 254,00 zł